Kemudian, tahun 2014-2015, dia terpilih sebagai Paban II Opslat Sops Mabesal. Pada tahun 2015-2016, ia menjabat sebagai Komandan Lantamal I Belawan dan Kepala Staf Koarmabar pada tahun 2016-2017.
Pada tahun 2017-2018, dia menjabat sebagai Panglima Kolinlamil (Komando Lintas Laut Militer).
Kemudian tahun 2018, Yudo menjabat sebagai Panglima Komando Armada RI Wilayah Barat (Pangarmabar). Tahun 2019, menjabat Panglima Kogabwilhan I. Pada tahun 2020 hingga sekarang, Yudo menjabat KSAL ke-27.
Pendidikan Militer Yudo Margono
– AAL (1988 A)
– Kursus Korbantem (1989)
– Kursus Perencanaan Operasi Amphibi (1990)
– Kursus Pariksa (1992)
– Dikspespa/Kom Angkatan 6 (1992/1993)
– Diklapa ll/Koum Angkatan 11 (1997/1998)
– Seskoal A-40 (2003)
– Sesko TNI A-38 (2011)
– Lemhannas Rl PPRA A-52 (2014)
Riwayat Jabatan Yudo Margono
– Asisten Perwira Divisi (Aspadiv) Senjata Artileri Rudal di KRI YNS 332 (1988)
– Kadep Ops KRI Ki Hajar Dewantara 364
– Palaksa KRI Fatahillah 361
– Komandan KRI Pandrong 801
– Komandan KRI Sutanto 877
– Komandan KRI Ahmad Yani 351
– Komandan Lanal Tual (2004—2008)
– Komandan Lanal Sorong (2008—2010)
– Komandan Satkat Koarmatim (2010—2011)
– Komandan Satkor Koarmatim (2011—2012)
– Komandan Kolat Koarmabar (2012—2014)
– Paban II/Opslat Sopsal (2014—2015)
– Komandan Lantamal I Belawan (2015—2016)
– Kepala Staf Koarmabar (2016—2017)
– Pangkolinlamil[7][8][9] (2017—2018)
– Pangkoarmabar (2018)
– Pangkoarmada I (2018—2019)
– Pangkogabwilhan I (2019—2020)
– Kasal (2020—Sekarang). (Red)
